一是水池、水箱是设计不合理。容积过大，增加了自来水在其中的停留时间，余氯挥发至零，造成细菌、大肠菌群超标。夏季水温较高，余氯挥发速度加快，24小时后即为零，不宜直接饮用。多数水池为钢筋混凝土结构，池壁粗糙，池面滋生微生物；有些水箱内壁涂料附着力差，有污染物溶出；没有防护涂层，大量铁锈掉落水中；出水管设置过高，出水管以下部分形成死水区，而且会有沉积物，造成水质污染；出水管设置过低，水池中的沉积物会进入出水管，进而进入整个给水系统，污染水质。

二是产权单位管理不善。城区内大量的二次供水设施属产权单位分散管理，缺少切实可行的卫生管理制度，从业人员缺乏专业知识，比如：将水池通气管封死，导致水池中通气不畅而使水质恶化；将通气管的防虫网罩损坏，使外界杂物、飞虫等进入水池；不按规定对蓄水设施进行定期清洗、消毒甚至从未清洗消毒过，更没有配备水质再消毒设施。